Stiftelsen Håll Sverige rent presenterar en skolsatsning där de erbjuder kommuner, skolledare och pedagoger gratis stöd för att arbeta med miljö- och hållbarhetsfrågor. Bland annat erbjuder de utbildning, inspiration, verktyg och material och satsningen genomförs i samarbete med Skolverket, Naturvårdsverket, Energimyndigheten samt Länsförsäkringar.
Håll Sverige rent har också nyligen inlett ett samarbete med Skolverket kring de två stora miljöutmärkelserna Grön flagg och Skola för hållbar utveckling. Meningen är att fler förskolor och skolor ska få hjälp att arbeta aktivt med hållbar utveckling och samarbetet går ut på att ge en samlad guidning och stöd i deras miljö- och kvalitetsarbete.