2006 infördes en högre ersättning för certifierad ekologisk produktion. Dessutom prioriterades produktion där skillnaden mot konventionell produktion är som störst, till exempel slaktsvin och fjäderfä. I Jordbruksverkets rapport konstateras att den certifierade ekologiska arealen har ökat med 20 procent mellan 2006 och 2008. Dessutom har den certifierade ekologiska djurhållningen ökat kraftigt.
Analysen visar att ökningen både beror på miljöersättningen och ökade priser på marknaden.