Den främsta förklaringen till att fler väljer att certifiera skogen är en ökad efterfrågan på certifierat timmer, papper och massa från europeiska uppköpare av skogsprodukter. Men flera svenska miljöorganisationer har kritiserat skogsbolagen och menat att FSCs regelverk inte efterföljs i praktiken. Kritiken rör såväl certifieringssystemets brist på delaktiga och transparenta beslutsprocesser som dess förmåga att nå positiva resultat för naturvården.
En ny avhandling från Umeå universitet visar att det är för tidigt att utvärdera certifieringarnas långsiktiga effekter på den biologiska mångfalden.